13个内设机构：办公室、总编室、全媒体编辑部、新闻部、国际部、地方记者部、发展研究部、策划运营部、科技创新传播中心、科学普及传播中心、技术研发部、财务部、人事部（机关党委）。

　　社属北京国科传媒文化有限公司负责运营报社经营性资产、资源。下属公司有国科网创新传媒（北京）有限责任公司、北京三环专家公寓、北京豪志会展服务有限责任公司、北京金卡尔广告公司等。

　　1986年1月1日《中国科技报》应运而生。同志为《中国科技报》题写报名。1987年1月1日，《中国科技报》更名为《科技日报》，同志再次题写了新的报名。

　　1988年4月，科技日报社采用计算机激光照排系统，从此告别“铅与火”。此后，报社曾在新技术和新设备应用方面开创了国内“四个第一”：1990年，报社实现局域网络排版；同年，完成了版面信息的整版光盘存储与数据检索系统开发工作。、同志曾亲自观看光盘数据检索系统演示。1991年1月1日，报社实现了电线日，报社出版了国内首张采用彩色激光照排系统制作的彩色报纸。

　　为更加深入贯彻落实习总对新闻工作提出的新要求，推动媒体融合向纵深发展，科技日报社提出了新的发展目标：以党的建设为统领，坚持一体化发展方向，着力打造以中国科技资讯库为根基，科技创新与科学普及为两翼，多平台智能化媒体和智库型媒体为特征的“一库两翼多平台”，实现流程优化、平台再造和各种媒介资源、生产要素有效整合，信息内容、技术应用、平台终端、管理手段共融互通，打造具有影响力的新型中央主流媒体。